ارزیابی مولکولی رابطه فیلوژنتیک جمعیت‌هایی از لاله واژگون ایران با استفاده از توالی ناحیه ITS

Authors

  • علیرضا بابائی نویسنده مسئول مکاتبات، استادیار، گروه باغبانی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران
  • محمود کیانی دانش‌آموخته دوره دکتری، گروه علوم باغبانی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران
  • محمّدرضا نقوی استاد، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تهران، کرج
Abstract:

   جنس لاله واژگون (Fritillaria) دربردارنده بیش از 140 گونه در خانواده سوسنیان می­باشد که از میان آنها گونه F. imperialis از نظر زینتی و دارویی از ارزش و اهمیت بالایی برخوردار است. تعداد 19 جمعیت از لاله واژگون از رویشگاه­های طبیعی خود واقع در 6 استان کشور جمع­آوری شدند. ارزیابی­های فیلوژنتیک بر اساس توالی ناحیه ITS در سطح DNA هسته­ای و با استفاده از روش‌های «نیبرجوینینگ» و «ماکسیمم لایکلی­هود» انجام شد. ژنوتیپ­های لاله واژگون در 3 گروه مختلف جای گرفتند؛ به­طوری­که جمعیت­های موجود در هر شاخه از الگوی منطقی نسبی پیروی کرده و بر اساس فاصله جغرافیایی و اختصاصات اقلیمی توزیع شدند. اگرچه 2 ژنوتیپ زرد رنگ در کنار 2 ژنوتیپ قرمزی که همگی از یک منطقه جمع­آوری شده بودند یک گروه جداگانه را تشکیل دادند، امّا بر اساس تمایز رنگی به­خوبی از یکدیگر تفکیک شدند. بر اساس مقادیر شاخص بوت­استرپ جدایش اعضاء درون گروه­ها اغلب به­خوبی انجام شد. نتایج این تحقیق نشان داد که توالی­های DNA در ناحیه ITS قابلیت بالایی برای یافتن روابط فیلوژنتیک جمعیت­های مختلف این گونه دارد. به‌طوری‌که تحقیق حاضر نخستین مطالعه انجام شده با استفاده از توالی ناحیه ITS برای ارزیابی مولکولی رابطه فیلوژنتیک جمعیت­های لاله واژگون می­باشد. 

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

ارزیابی مولکولی رابطه فیلوژنتیک جمعیت هایی از لاله واژگون ایران با استفاده از توالی ناحیه its

جنس لاله واژگون (fritillaria) دربردارنده بیش از 140 گونه در خانواده سوسنیان می­باشد که از میان آنها گونه f. imperialis از نظر زینتی و دارویی از ارزش و اهمیت بالایی برخوردار است. تعداد 19 جمعیت از لاله واژگون از رویشگاه­های طبیعی خود واقع در 6 استان کشور جمع­آوری شدند. ارزیابی­های فیلوژنتیک بر اساس توالی ناحیه its در سطح dna هسته­ای و با استفاده از روش های «نیبرجوینینگ» و «ماکسیمم لایکلی­هود» ان...

full text

تجزیه و تحلیل مولکولی جمعیتی از مرغ لاری با استفاده از توالی ناحیه HVR-I ژنوم میتوکندری

مرغ‌های بومی ایرانی مواد ژنتیکی پایه برای برنامه های اصلاح نژاد محسوب میشوند. انجام برنامه‌های اصلاح نژادی در گام نخست نیازمند شناسایی و حفظ تنوع ژنتیکی این جمعیت هاست. بررسی ژنوم میتوکندری در یک نژاد و مقایسه آن با سایر نژادها میتواند شاخص مناسبی از میزان تنوع موجود در جمعیت مورد بررسی را ارائه دهد. در مطالعه حاضر، به منظور ارزیابی تنوع ژنتیکی مرغان لاری ایران، تعداد 23 قطعه مرغ از منطقه لارست...

full text

بررسی تنوع کاریوتیپی در برخی از گونه‌های سرده لاله واژگون (تیره لاله)

در این مطالعه کاریوتیپ پنج گونه از سرده لاله واژگون شامل: Fritillaria avromanica، F. assyriaca،F. chlorantha ، F. persica و F. raddeana، متعلق به سه زیر جنس، گردآوری شده از نواحی مختلف ایران ارائه شده است. همه گونه‌ها دیپلوئید (2n = 2x = 24) بوده و میانگین طول کروموزوم‌ها 86/15 میکرومتر بود. چهار نوع کروموزوم (‘‘m’’, ‘‘sm’’, ‘‘st’’, ‘‘T’’)، پنج فرمول کاریوتیپی متفاوت را ایجاد کردند. شمارش کرومو...

full text

تجزیه فیلوژنتیک و هاپلوگروهی بزهای بومی ایران بر اساس توالی نوکلئوتیدی ناحیه HVR1 ژنوم میتوکندری

بزهای بومی ایران به­عنوان یکی از ذخایر ژنتیکی ارزشمند محسوب می­شوند و حفظ تنوع ژنتیکی آنها حائز اهمیت است. ژنوم میتوکندری در یک اکوتیپ و مقایسه آن با سایر اکوتیپ­ها می­تواند شاخص مناسبی از میزان تنوع موجود در آن جمعیت را ارائه دهد. هدف از پژوهش اخیر بررسی ساختار ژنتیکی و ترسیم روابط فیلوژنتیکی ناحیه HVR1 میتوکندری چهار توده جمعیتی بز­های بومی ایران شامل سیستانی، پاکستانی، عدنی و سیاه لری (هر کد...

full text

بررسی تنوع ژنتیکی لاله ی واژگون (l. f. imperialis) با استفاده از مارکر مولکولی rapd

جنس فریتیلاریا در حدود 100 گونه دارد که بیشتر در نواحی گرم نیمکره ی شمالی شامل آمریکای شمالی، اروپا و همین طور نواحی مدیترانه ای در آسیای مرکزی تا چین و ژاپن دیده می شود. لاله ی واژگون گیاهی است که از نظر دارویی دارای اهمیت فراوان است، و به طور وسیع در صنعت داروسازی مورد استفاده قرار می گیرد. بررسی تنوع ژنتیکی درون گونه ها اطلاعات ضروری در مورد تاریخچه ی تکاملی آن ها و همچنین اطلاعاتی در مورد ع...

اثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین

Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 23  issue 1

pages  30- 39

publication date 2015-06-22

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023